c1e58983d1
a port they release a new version. This is a new version, w/o a number. PR: 22522 Submitted by: Tony Maher <tonym@dt.home> MAINTAINER
178 lines
5.9 KiB
Plaintext
178 lines
5.9 KiB
Plaintext
--- make/makeall.unx.orig Sat Jul 8 04:16:35 2000
|
|
+++ make/makeall.unx Tue Oct 24 22:35:34 2000
|
|
@@ -782,3 +782,174 @@
|
|
#load $(LDFLAGS) getmuid.c medutil.c \
|
|
$(SRC11) $(SRC8) $(SRC7) $(SRC6) $(SRC5) $(SRC3) \
|
|
$(SRC2) $(SRC1) $(OTHERLIBS) -lsocket -lnsl
|
|
+
|
|
+EXE= Nentrez Psequin \
|
|
+ asn2fast asn2ff asndhuff asntool \
|
|
+ bl2seq blast.REAL blastall blastcl3 blastclust blastpgp \
|
|
+ cdscan checksub copymat \
|
|
+ ddv dosimple \
|
|
+ entrcmd errhdr fa2htgs fastacmd findspl fmerge formatdb \
|
|
+ getfeat getmesh getpub getseq gil2bin \
|
|
+ idfetch impala indexpub \
|
|
+ makemat makeset megablast \
|
|
+ ncbisort netentcf \
|
|
+ rpsblast \
|
|
+ seedtop seqtest \
|
|
+ tbl2asn testcore testobj testval \
|
|
+ udv vecscreen
|
|
+
|
|
+
|
|
+LIB= libncbi.a libncbicdr.a libncbimla.a libncbitxc2.a \
|
|
+ libnetentr.a libncbiCacc.a libncbicn3d.a libncbimmdb.a \
|
|
+ libnetblast.a libvibgif.a libncbiNacc.a libncbidesk.a \
|
|
+ libncbiobj.a libnetcli.a libvibnet.a libncbiacc.a \
|
|
+ libncbiid1.a libncbitool.a libnetcli_.a libvibrant.a
|
|
+
|
|
+
|
|
+INC= actutils.h matrix.h rpsutil.h \
|
|
+ asnblock.h mbalign.h saldist.h \
|
|
+ asncode.h mblast.h saled.h \
|
|
+ asnent2.h mbutils.h saledit.h \
|
|
+ asnfdef.h mconsist.h salfiles.h \
|
|
+ asnfeat.h mdrcherr.h salign.h \
|
|
+ asngen.h medarch.h salmedia.h \
|
|
+ asnid0.h medutil.h salogif.h \
|
|
+ asnloc.h medview.h salpacc.h \
|
|
+ asnmdrs.h mkbioseq.h salpanel.h \
|
|
+ asnmedli.h mmdb1.h salparam.h \
|
|
+ asnmime.h mmdb2.h salpedit.h \
|
|
+ asnmla.h mmdb3.h salprop.h \
|
|
+ asnneten.h mmdbapi.h salpstat.h \
|
|
+ asnproj.h mmdbapi1.h salptool.h \
|
|
+ asnprt.h mmdbapi2.h salsa.h \
|
|
+ asnpub.h mmdbapi3.h salsap.h \
|
|
+ asnpubme.h mmdbapi4.h salstruc.h \
|
|
+ asnres.h mmdbdata.h salutil.h \
|
|
+ asnseq.h mmdblocl.h samutil.h \
|
|
+ asnsset.h ncbi.h satutil.h \
|
|
+ asnsubmt.h ncbibs.h sdisplay.h \
|
|
+ asntax1.h ncbibuf.h sec.h \
|
|
+ asntaxon.h ncbicli.h seed.h \
|
|
+ bandalgn.h ncbidraw.h seg.h \
|
|
+ binary.h ncbienv.h seqanal.h \
|
|
+ biosrc.h ncbierr.h seqcons.h \
|
|
+ blast.h ncbifile.h seqfltr.h \
|
|
+ blastdef.h ncbigif.h seqgraph.h \
|
|
+ blastkar.h ncbilang.h seqgrphx.h \
|
|
+ blastpat.h ncbilcl.h seqmgr.h \
|
|
+ blastpri.h ncbimain.h seqmtrx.h \
|
|
+ blocks.h ncbimath.h seqpcc.h \
|
|
+ blstspc.h ncbimem.h seqport.h \
|
|
+ bspview.h ncbimisc.h seqscrl.h \
|
|
+ casn.h ncbimsg.h seqsub.h \
|
|
+ cdconfig.h ncbinet.h sequtil.h \
|
|
+ cdd.h ncbiopt.h shim3d.h \
|
|
+ cdentrez.h ncbiport.h simple.h \
|
|
+ cdnewlib.h ncbiprop.h simutil.h \
|
|
+ cdrgn.h ncbisam.h spell.h \
|
|
+ cdrom.h ncbisami.h splutil.h \
|
|
+ cdromlib.h ncbisgml.h sqnutils.h \
|
|
+ cn3dentr.h ncbisock.h strimprt.h \
|
|
+ cn3dmain.h ncbisort.h stsutil.h \
|
|
+ cn3dmesh.h ncbisrti.h subutil.h \
|
|
+ cn3dmodl.h ncbistd.h suggapi.h \
|
|
+ cn3dmsel.h ncbistr.h suggen.h \
|
|
+ cn3dmsg.h ncbithr.h suggest.h \
|
|
+ cn3dopen.h ncbitime.h suggslp.h \
|
|
+ cn3dsave.h ncbiurl.h sugmap.h \
|
|
+ cn3dshim.h ncbiwin.h sugprefx.h \
|
|
+ cn3dstyl.h ncbiwww.h tax0.h \
|
|
+ cn3dxprt.h netblap3.h tax1map.h \
|
|
+ codon.h netcnfg.h taxblast.h \
|
|
+ con_file.h netentr.h taxext.h \
|
|
+ con_sock.h netlib.h taxinc.h \
|
|
+ con_stateless.h netpriv.h taxon1.h \
|
|
+ con_url.h netscape.h taxuerr.h \
|
|
+ ni_asn.h taxutil.h \
|
|
+ connectn.h ni_defin.h terr.h \
|
|
+ connectr.h ni_encr.h tfuns.h \
|
|
+ connutil.h ni_error.h toasn3.h \
|
|
+ corematx.h ni_lib.h tofasta.h \
|
|
+ db_list.h ni_lib_.h tofile.h \
|
|
+ ddvclick.h ni_list.h tomedlin.h \
|
|
+ ddvcolor.h ni_msg.h toporg.h \
|
|
+ ddvcreate.h ni_net.h tree.h \
|
|
+ ddvgraph.h ni_types.h treemgr.h \
|
|
+ ddvmain.h objacces.h treeview.h \
|
|
+ ddvopen.h objalign.h treevint.h \
|
|
+ ddvpanel.h objalignloc.h tsprintf.h \
|
|
+ diagnost.h objall.h txalign.h \
|
|
+ dlogutil.h objbibli.h txclient.h \
|
|
+ document.h objblock.h txcommon.h \
|
|
+ dotmatrx.h objblst3.h udvdef.h \
|
|
+ drawingp.h objcdd.h udviewer.h \
|
|
+ drawseq.h objcode.h udvseq.h \
|
|
+ dust.h objent2.h undefwin.h \
|
|
+ dvncode.h objentr.h urkbias.h \
|
|
+ echo_asn.h objfdef.h urkcnsrt.h \
|
|
+ edutil.h objfeat.h urkdust.h \
|
|
+ ent2api.h objgen.h urkepi.h \
|
|
+ entrez.h objloc.h urkfltr.h \
|
|
+ errdefn.h objmdrs.h urkgraph.h \
|
|
+ explore.h objmedli.h urkpcc.h \
|
|
+ fea2seg.h objmgr.h urkptpf.h \
|
|
+ ffprint.h objmime.h urksigu.h \
|
|
+ findrepl.h objmla.h urktree.h \
|
|
+ fstyle.h objmmdb1.h urkutil.h \
|
|
+ fstylep.h objmmdb2.h urlquery.h \
|
|
+ ftusrstr.h objmmdb3.h utilpars.h \
|
|
+ gapxdrop.h objneten.h utilpub.h \
|
|
+ gather.h objproj.h valid.h \
|
|
+ gbfeat.h objprt.h validatr.h \
|
|
+ gbftdef.h objpub.h validerr.h \
|
|
+ gbparlex.h objpubd.h vast2cn3d.h \
|
|
+ gifgen.h objpubme.h vast2mage.h \
|
|
+ glbpic.h objres.h vast2pdb.h \
|
|
+ gphdraw.h objseq.h vastlocl.h \
|
|
+ gtrdraw.h objsset.h vastsrv.h \
|
|
+ gxydraw.h objsub.h vecscnapi.h \
|
|
+ id1.h objtax1.h vecscrn.h \
|
|
+ id1arch.h objtaxc0.h vibdefns.h \
|
|
+ id1gen.h odlbox.h vibfltr.h \
|
|
+ id1map.h panels.h vibforms.h \
|
|
+ image.h parsegb.h vibgraph.h \
|
|
+ imagelst.h pdiagnos.h vibincld.h \
|
|
+ import.h pgppop.h vibmouse.h \
|
|
+ jzcoll.h pictur3d.h vibpcc.h \
|
|
+ jzmisc.h picture.h vibprocs.h \
|
|
+ layout.h picturep.h vibrant.h \
|
|
+ lbapi.h pmfapi.h vibtree.h \
|
|
+ legend.h pobutil.h vibtypes.h \
|
|
+ list.h posit.h viewer.h \
|
|
+ lnfac.h ppict3d.h viewer3d.h \
|
|
+ lookup.h profiles.h viewerp.h \
|
|
+ lsqfetch.h prtgene.h viewmgr.h \
|
|
+ mapgene.h prtutil.h vsm.h \
|
|
+ mapmime.h prunebsc.h vsmfile.h \
|
|
+ mapmla.h pubdesc.h vsmpriv.h \
|
|
+ mappingp.h puberr.h vsmutil.h \
|
|
+ mapproj.h qblastapi.h wwwblast.h \
|
|
+ mappubme.h readdb.h \
|
|
+ maputil.h regex.h
|
|
+
|
|
+MKDIR= /bin/mkdir -p
|
|
+INSTALL_PROGRAM= /usr/bin/install -c
|
|
+
|
|
+binstall: $(EXE)
|
|
+ ${MKDIR} ${PREFIX}/bin
|
|
+ ${INSTALL_PROGRAM} -s $? /${PREFIX}/bin
|
|
+
|
|
+linstall: $(LIB)
|
|
+ ${MKDIR} ${PREFIX}/lib/ncbi
|
|
+ ${INSTALL_PROGRAM} $? ${PREFIX}/lib/ncbi
|
|
+
|
|
+iinstall::
|
|
+ ${MKDIR} ${PREFIX}/include/ncbi
|
|
+ pwd
|
|
+ cd ../include; \
|
|
+ for file in $(INC); do \
|
|
+ ${INSTALL_PROGRAM} $$file ${PREFIX}/include/ncbi; \
|
|
+ done
|
|
+
|
|
+install: linstall binstall
|
|
+
|